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硅藻的生态意义浮游生物的个体虽然小得微不足道，却是水中原始食物的生产者，要是没有它们，水里的大生命恐怕也就无法生存了。
尤其是硅藻，营养丰富，容易消化，不仅浮游动物、小鱼小虾和贝类喜欢吃，许多大家伙，像鲸等又都以小鱼小虾等为食料。因此硅藻等浮游生物的多寡，明显地决定着鱼类的产量，这是无可置疑的了。每年春天，对虾和许多鱼类都喜欢来我国渤海、黄河口一带产卵，就是因为这里风平浪静，水温适宜，硅藻非常丰富的缘故。有人估计，海豹长膘450克，需要消耗约0.5吨硅藻。另外，据报道，浮游生物每年制造的氧气就有360亿吨，占地球大气氧含量的70%以上。由于硅藻数量又占浮游生物数量的60%以上，这样可以推算，假设现在地球上没有硅藻了，不用3年，地球上的氧气就耗干了。动物和我们人类也就都没法呼吸了。
硅藻死后，它们坚固多孔的外壳——细胞壁也不会分解，而会沉于水底，经过亿万年的积累和地质变迁成为硅藻土。硅藻土可被开采，在工业上用途很广，可制造工业用的过滤剂、隔热及隔音材料等等。我国山东山旺地区就出产大量的硅藻土。游泳池的主人将老化的硅藻壳拿来过滤水里的污染物质。诺贝尔奖的创始人Alfred Nobel发现将不稳定的硝化甘油放入硅藻所产生的硅土后可以稳定地成为可携带的炸药。
硅藻的危害海洋环境如果受到富营养污染或其他原因，常使某些硅藻如骨条藻、菱形藻、盒形藻、角毛藻、根管藻、海链藻等生殖过盛，形成赤潮，使水质恶劣，对渔业及其他水产动物带来严重危害。
有些硅藻（如根管藻）生殖太盛并密集在一起，可阻碍或改变鲱鱼的洄游路线，降低渔获量。
硅藻——水中艺术品硅藻是水中有机物质初级生产者之一，它们的构造奇特，巧夺天工，呈现许许多多美妙的不可思议的花纹和图案，它们的身体却非常微小，一般小的仅有千分之几毫米，大的也不超过1～2毫米。在那清澈透亮的水滴中，隐藏着它们的身影，必须借助光学或电子显微镜才能窥探其尊容。别以为它们个体小，其实一个小细胞就是一个完整的生命体。当外界条件适宜，硅藻大量繁殖时，能使数万平方千米的海水改变颜色。水生动物的幼体以及鲻鱼、牡蛎、蛏、蛤……和肉眼不易看到的恒河沙数的浮游动物都直接地依靠吞食硅藻等这类小微型生物为生。俗话说“大鱼吃小鱼，小鱼吃虾米”，那么“虾米”吃什么？就是吃这样的一些小微型生物了。
